ภาพยนตร์เรื่อง พระพิฆเนศ มหาเทพแห่งปัญญา 2 เป็นเรื่องเกี่ยวกับวีรกรรมความกล้าหาญ การใช้สติปัญญาในการแก้ปัญหาของพระพิฆเนศในการเขียนหนังสือของฤๅษีตนหนึ่ง และเมื่อพระพิฆเนศทำผิด ท่านก็ได้รับการอบรมสั่งสอนจากพระแม่ปารวตี รวมทั้งบอกต้นกำเนิดของราชาหนู ข้ารับใช้และพาหนะคู่ใจของพระพิฆเนศด้วย