เม่นสีน้ำเงินตัวโปรดของโลกกลับมาแล้วสำหรับการผจญภัยระดับต่อไปใน โซนิค เดอะ เฮดจ์ฮ็อค 2 หลังจากที่ย้ายมาลงหลักปักฐานที่กรีนฮิลส์ โซนิคก็กระตือรือร้นที่จะพิสูจน์ว่าเขามีคุณสมบัติในการเป็นฮีโร่ที่แท้จริง บททดสอบของเขาเกิดขึ้นเมื่อดร.โรบ็อทนิค จอมวายร้ายกลับมา และคราวนี้ เขาก็มาพร้อมกับคู่หูคนใหม่ นัคเคิลส์ เพื่อออกตามหามรกตที่มีพลังทำลายล้างอารยธรรม โซนิคได้ร่วมมือกับ เทลส์ ไซด์คิกของเขาเอง และพวกเขาร่วมกันออกเดินทางท่องโลกเพื่อค้นหามรกตก่อนที่มันจะตกไปอยู่ในมือของวายร้าย