กิกิ คือ แม่มดน้อยวัย 13 ปี ตามธรรมเนียมของแม่มด เมื่อแม่มดที่มีอายุครบ 13 ปี ต้องออกจากบ้านไปอยู่ในเมืองอื่นๆ ที่ไม่มีแม่มดคนใดอาศัยอยู่เป็นเวลา 1 ปี เพื่อเรียนรู้การอยู่ด้วยตัวเองเพียงลำพัง และฝึกหัดการค้าขายไปพร้อมๆ กัน นี่คือจุดเริ่มต้นของเรื่องราวการจากบ้านของกิกิ ในตอนแรก เธอและจีจี้ เจ้าแมวเหมียวสีดำต้องพบกับอุปสรรคเล็กๆ น้อยๆ แต่ไม่นานนัก พวกเขาก็มีเพื่อนมากมายในเมืองใหม่ที่อยู่ใกล้ท้องทะเลแห่งนี้