ในภาคนี้อินเดียน่าโจนส์ และเพื่อนร่วมทีมอีกสองคนได้แก่นักร้องไนท์คลับ และเด็กชายวัยสิบสองปี ได้เดินทางสู่หมู่บ้านแห่งหนึ่งในอินเดีย เพื่อตามหาก้อนหินศักดิ์สิทธิ์ ที่ชาวบ้านเชื่อกันว่าที่มีส่วนต่อการหายตัวไปอย่างลึกลับ ของเด็ก ๆ ในหมู่บ้าน อินเดียน่าเลยต้องออกมาหาก้อนหินที่ว่านี้กลับคืนมาให้แก่หมู่บ้าน