หลังจากถูกเปิดเผยตัวตนที่แท้จริง ความรับผิดชอบอันยิ่งใหญ่ของการเป็นซูเปอร์ฮีโร่ ขัดแย้งกับการดำเนินชีวิตแบบธรรมดาของเขาและทำให้คนที่เขารักตกอยู่ในอันตราย เขาจึงได้ไปขอความช่วยเหลือจากด็อกเตอร์สเตรนจ์เพื่อใช้เวทมนต์ทำให้ทุกคนลืมตัวตนจริงของ สไปเดอร์-แมน แต่แล้วได้เกิดเหตุการณ์ระหว่างร่ายมนต์ทำให้ส่งผลกระทบกับมัลติยูนิเวิรส์ปลดปล่อยอสรุกายร้ายที่เคยต่อกรกับ สไปเดอร์-แมนในพหุภพต่าง ๆ ออกมา ปีเตอร์ พารค์เกอร์ (ทอม ฮอลแลนด์) จะต้องลุกขึ้นสู้กับอุปสรรคอันใหญ่หลวงครั้งนี้ที่จะเปลี่ยนแปลงไม่ใช่แค่ชีวิตเขา แต่รวมถึงอนาคตของพหุภพต่าง ๆ อีกด้วย