ฮิบิกิ ยูตะ เด็กหนุ่มที่เพิ่งฟื้นจากอาการความจำเสื่อม มีความสามารถในการเห็นพลังงานบางอย่างที่คนทั่วไปมองไม่เห็น รวมไปถึง ?กริดแมน? ผู้พิทักษ์โลกไซเบอร์ที่คอยปราบปรามสิ่งผิดปกติ หรือไวรัสคอมพิวเตอร์ทั้งหมดในโลกไซเบอร์ รวมทั้งพวกที่หลุดมายังโลกจริง ซึ่งกริดแมน ก็ได้มาสถิตย์ในคอมพิวเตอร์ของเพื่อนร่วมชั้นอย่าง ทาคาราดะ ริกกะ จนกระทั่งวันหนึ่ง ยูตะถูกดูดเข้าไปในโลกไซเบอร์ และได้ทำสัญญาบางอย่างกับกริดแมน เขาจึงต้องทำหน้าที่ปกป้องโลกไซเบอร์ และโลกความเป็นจริงไปพร้อมๆ กัน